关于乡镇政府90年前招聘的农村户口员工，他们的

工龄计算需视户口性质，农村户口员工一般不计算工龄。根据《关于工龄计算的相关规定》，原农村户口员工，城镇读书毕业后返乡，不计算工龄。未及时明确工龄，可能影响员工退休待遇及社保福利。
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工龄计算方式因户口而异，城镇户口可计算，农村户口则否。处理方式需根据员工户口性质确定，若为城镇户口且符合条件，则按规定计算工龄；若为农村户口，则需明确告知其工龄计算规定。
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工龄计算与户口有关。1.若为原城镇户口或下乡知青，工龄按相关规定计算，确保员工权益。2.若为原农村户口且城镇读书后返乡，需明确告知其不计算工龄，并解释原因及可能的影响，如退休待遇、社保等。3.对于特殊情况，建议咨询专业律师，以法律为准绳，确保处理公正合法。